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No, no es peligroso.
No existe ningún problema en repetirte una endoscopia de vías digestivas, esto no va a causar ningún problema en tu cuerpo.
Sin embargo yo te recomiendo asesorarte muy bien de tu médico, ya que existen otros métodos para ver si hay infección por Helycobacter Pilory y podría NO ser necesaria la endoscopia.
Espero haberte ayudado y estaré atento si tienes más dudas para poder orientarte.