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El tratamiento generalmente va dirigido a la condición asociada porque, en general, el trastorno en sí mismo no requiere intervención. La erradicación de Giardia a menudo hace que los síntomas intestinales desaparezcan.
Teniendo en cuenta el riesgo de transformación maligna, algunos autores recomiendan las endoscopias de cápsula de vigilancia y las series de intestino delgado d forma periódica, y tomar biopsia de las lesiones de rápido crecimiento para descartar transformación linfomatosa.
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