He tenido mucho dolor y ardor en los pulmones y he asistido al médico y me ha mandado unos médicamentos para desinflamar pero el dolor persiste , que puede ser?

Los síntomas que refieres son compatibles con los de una Pleuresía o Pleuritis, la cual consiste en la inflamación de una de las capas de los pulmones, en la mayoría de los casos secundario a un proceso infeccioso e irritativo. 

Como medidas generales te recomiendo:

• Consumir analgésicos antiinflamatorios (ibuprofeno, diclofenac, ketorolac) de venta libre.
• Evitar la exposición a lugares con bajas temperaturas.
• Evitar la exposición a moho, humo, polen o polvo. 
• Mantener reposo. 

Estas molestia puede extenderse desde un par de días hasta 2 semanas, por lo cual, si pasado dicho tiempo, no has evidenciado mejoría o presentas dificultad respiratoria y fiebre, debes acudir a una valoración médica. 

Espero haber aclarado tu duda, ante cualquier nueva inquietud, estaremos atentos. No olvides calificarnos.