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Siempre que se tengan relaciones sexuales existe riesgo de embarazo, cuándo se usa algún tipo de método anticonceptivo, las probabilidades disminuyen de forma considerable.
La efectividad de los anticonceptivos hormonales es mayor al 99% siempre que se use de forma adecuada, es decir sin retrasos ni olvidos en su administración, por lo que considero que es más probable que tu retraso / ausencia del periodo, sea secundario al medicamento que a un embarazo (ya que uno de los efectos secundarios más comunes de los anticonceptivos inyectables es la irregularidad del ciclo menstrual).
Sin embargo, en caso de que tengas muchas dudas, puedes tomar una prueba que descarte esta cómo la causa de tus síntomas, en sangre se sugiere realizarla hacia los 10-14 días de la relación sexual y en orina hacia las 3 semanas, para que los resultados sean confiables.
Espero haber podido ayudarte y orientarte.