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Si te han realizado exámenes donde han descartado infecciones urinarias o peneanas como infecciones de transmisión sexual, la causa de estos cambios a nivel de tu semen y pene puede ser por cambios en la alimentación o que estés cursando con una uretritis no infecciosa.
En este caso mi recomendación es que asistas a un urólogo para que te examinen y te realicen otros exámenes más específicos que podrán indicar la causa de los cambios de tu semen.
En caso de presentar dolor o ardor al orinar, orina con sangre, fiebre o malestar general debes asistir a urgencias.
Espero que mi respuesta aclare tus dudas y te invito a que me califiques