El cyclonor te protege desde el primer día de la aplicación, por lo tanto como te la aplicaste en el periodo óptimo del ciclo menstrual, es poco probable que estés embarazada, pues su tasa de efectividad es de un 98%.
Si bien, lo síntomas que describes pueden ser efectos adversos de este medicamento, mi recomendación es que si el dolor es muy intenso y adicional a lo que mencionas tienes otros síntomas como flujo vaginal anormal, fiebre, nauseas o vómito acudas a una consulta con tu médico para que descarten alguna otra causa del dolor pélvico que requiera estudios de extensión o alguna otra intervención.
Si no presentas nada de lo anterior y el dolor disminuye y aun así tienes dudas sobre un posible embarazo, lo mejor es que esperes a la fecha de tu ciclo menstrual y si pasados 7 días de la fecha esperada no llega, te realices una prueba de embarazo. No olvides que la inyección debe ser aplicada exactamente al mes de puesta la primera dosis.