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No, el tratamiento que lleves para tratar la infección vaginal no causará que el anticonceptivo disminuya su efecto, es decir que continuarás protegida, sin embargo no se recomienda que tengas relaciones sexuales durante el tratamiento, esto no es porque disminuya el anticonceptivo es porque puedes intervenir con el tratamiento y evitar una curación adecuada.
Si tienes más dudas es necesario que vuelvas a formular otra pregunta, estaré al pendiente de tus dudas.