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Si, al haber descartado el embarazo con la prueba puedes aplicarla en cualquier momento, solo que al no aplicarla con la menstruación debes esperar 7 días para volver a estar protegida.
Al ser una inyección mensual, debes aplicarla cada 30 días +/- 3 días, es decir que debes aplicar la siguiente dosis del día 27 al día 33 desde la última dosis, esto quiere decir que si la aplicas hoy 29 de Julio la siguiente dosis debes aplicarla del 24 al 30 de Agosto para que estes protegida desde el primer día, si se aplica pasando los 33 días desde la última dosis no estarás protegida desde el primer día y por ello debes esperar 7 días para estar protegida.
Si tienes más dudas es necesario que vuelvas a formular otra pregunta, estaré al pendiente de tus dudas.