¿Por qué puedo tener un retraso de 3 meses en mi periodo, si se ha descartado embarazo y quistes en los ovarios? 

Lo más recomendado es que se continúen los controles con el especialista ya que él es quien tiene las herramientas para poder dar un diagnóstico. Lo primero que se realiza es una prueba de embarazo y luego descartar algo anatómico, pero si esto ya se realizó, se deben realizar exámenes complementarios para estudiar las hormonas que regulan el ciclo menstrual y el único que puede realizar estos exámenes es el ginecólogo.