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En caso de que llegues a presentar dolor pélvico intenso, náuseas o vomito persistentes, fiebre, que sientas que tu bebe se mueve menos de lo normal (si ya lo sientes), si sientes que el abdomen se pone duro / contraído, si hay sangrado vaginal o salida de líquido por la vagina, debes consultar de forma prioritaria ya que éstos pueden ser signos de alarma.
El embarazo es un estado de la mujer que favorece el desarrollo de infecciones en la cavidad vaginal, dado que refieres que el flujo está grumoso, te sugiero consultar con tu médico para que revise el flujo y determine si hay infección antes de que reinicies el tratamiento ya que podrías requerir cambio de tratamiento.
Espero haber podido ayudarte y orientarte.