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No es necesario con las pruebas que has realizado se descarta un embarazo, no tienes de que preocuparte has estado colocando correctamente la inyección anticonceptiva, por lo tanto has estado protegida en tus relaciones sexuales aún sin el uso de preservativo, la azitromicina no disminuye el efecto del anticonceptivo.
Las irregularidades menstruales son comunes con el uso del anticonceptivo hormonal inyectado, al ser un anticonceptivo hormonal puede causar irregularidades menstruales y cambios en el sangrado menstrual, puedes presentar un sangrado leve, sangrado abundante, manchados o sangrados entre menstruaciones e inclusive ausencia de la menstruación. Son efectos esperados y no todos los meses debes presentar lo mismo, esto no disminuirá el efecto del anticonceptivo.
Si tienes más dudas es necesario que vuelvas a formular otra pregunta, estaré al pendiente de tus dudas.