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Todas son tipos de imágenes buenas, pero va a depender de su indicación definir cual es mejor.
Por ejemplo para fracturas es mejor la tomografía, pero para evaluar lesiones de tendones, ligamentos o tejidos blandos, es mejor la resonancia.
En este caso a nivel del cráneo suele ser mejor la utilización de la resonancia por encima de la tomografía.
Espero haberte ayudado y estaré atento si tienes más dudas para poder orientarte.