Según las circunstancias que refiere no creo que se trate de un estado de embarazo, ya que usó el preservativo, estaba haciendo uso de las pastillas (si bien es cierto que el efecto no es máximo durante el primer mes) y por otro lado fue en los días finales de su ciclo menstrual que son días más bien de bajo riesgo de embarazo.
Ahora, el contacto de la pequeña cantidad de semen con la mucosa vaginal no creo que sea suficiente para lograr el embarazo aunque el riesgo exista. En conclusión realmente no creo que se trate de un embarazo sino de un cambio temporal en su menstruación producto del retraso que tuvo. Ante la duda, a pesar de mi orientación, hágase una prueba.