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Es probable, que sea por culpa del tratamiento que acabas de iniciar.
Los niveles de hormonas tiroideas hacen parte de las sustancias que pueden alterar tu ciclo menstrual, bien sea aumentando el sangrado o causando irregularidad.
Por el momento no debes preocuparte, Ya que no has tenido ninguna relación sexual, por lo que no hay riesgo de embarazo. Con el tiempo se va a ir normalizando de nuevo tu ciclo menstrual.
Espero haberte ayudado y estaré atento si tienes más dudas para poder orientarte.