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El origen de las fisuras anales por lo general obedece a la presencia de constipación o estreñimiento, esto causa que la consistencia de las heces sea muy compacta además de tener poco contenido de agua y al salir por el recto en la defecación, rasga la mucosa anal y/o rectal y esto genera ardor, picor y sangrado secundario. Es raro que una infección como tal, sea la causa de fisuras anales.