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En primer lugar habría que establecer realmente que tipo de vaginosis es la que te está afectando. De ser una vaginosis bacteriana no hay motivo para estar en tratamiento con clotrimazol, siendo este un antifúngico, es decir, un medicamento que combate los hongos.
El clotrimazol tiene un acción principalmente local por lo que no tiene justificativo que tu esposo tome este medicamento.
Te recomiendo aclarar la situación clínica con tu médico tratante. Mientras tanto procura:
El uso de un método de barrera como preservativo masculino o femenino es totalmente necesario para prevenir el contagio de enfermedades de transmisión sexual (ETS) siendo además un excelente método anticonceptivo.
Entiendo esta pueda ser una situación incómoda pero con el manejo adecuado podrás superarla rápidamente. Espero te resulte útil la orientación brindada. No olvides calificarnos.