Se han identificado más de 100 genotipos de VPH.
Se clasifican "alto riesgo oncogénico" : 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58 y 59, los nombrados de "probable/posible alto riesgo oncogénico" son 68, 26, 53, 64,65, 66, 67, 69, 70, 73, 82 y los de "bajo riesgo, no oncogénicos" son 6 y 11.
Los más frecuentes en todo el mundo son VPH16, VPH18, VPH52, VPH31 y VPH58