La ampicilina normalmente no causa cambios en el color de la orina. Sin embargo es un efecto que se puede presentar. En tu caso hace 20 días también tuviste una cirugía de la vesícula que podría ser otra causa de orina café, por algún cálculo en la vía biliar. Otra causa podría deberse a alguna infección en la orina, sin embargo es poco probable ya que al parecer no presentas ardor, fiebre, aumento o disminución en la cantidad de orina.
Por lo tanto mi recomendación, es cuando vayas al control con el doctor le cuentes eso, para que realice los exámenes pertinentes de orina y determine la causa exacta. Espero haber sido de ayuda.