Son muy bajas las posibilidades de embarazo en el caso de tu pareja, puesto que ya ha presentado con normalidad sus sangrados menstruales, los cuales indican que no hay presencia de embarazo.
Los síntomas que presenta son muy inespecíficos, y pueden hacer referencia a varias patologías especialmente de índole gastrointestinal, por lo cual le recomiendo acudir a una valoración médica presencial para determinar la causa e instaurar el manejo adecuado.
Si desean estar mas tranquilos en cuanto al tema del embarazo, puede realizarse una prueba de embarazo en orina o sangre, las cuales son confiables pasados 10 a 14 días de la relación sexual de riesgo o 1 o 2 semanas de retraso menstrual, si este ocurre.
Espero haber aclarado tu duda, ante cualquier nueva inquietud estaremos atentos. No olvides calificarnos.