tengo dos bolitas en el paladar por dentro y me duelen al tocarlas, pero a veces desaparecen, no son tan grandes, de qué se trata?

Es posible que se trate de cambios por traumatismos en el paladar por la alimentación o el cepillado. Podría asociarse a cambios como un granuloma piocítico. No aparenta mayor peligro, sin embargo, sería importante que estos cambios sean asesorados presencialmente por un profesional capacitado como un odontólogo o un médico.