El Síndrome de Colon Irritable no tiene una cura definitiva, los síntomas sí se pueden controlar con medicamentos, dieta y actividad física regular además de hacer controles médicos periódicos si se considera necesario.
La limpieza de colon se puede hacer pero cada procedimiento tiene sus indicaciones y contraindicaciones propias. La limpieza puede hacerse con equipos especiales para tal fin o simplemente con el uso de una medicación laxativa que evacúe completamente el contenido colónico, tal como se recomienda en ocasiones para algunas cirugías o para realizar colonoscopias.