La coloración normal del semen es transparente-blanca o un tono ligeramente amarillento, las características dependerán del grado de estimulación o secreción de glándulas anexas como la próstata y vesiculas seminales, el tiempo entre eyaculación y la hidratación.
La presencia de coloración amarillenta, verdosa o rojiza indican patología que puede ser secundario a infecciones, traumatismos, tumores.