El orinar verde puede ser un efecto adverso del medicamento que sea que te pongan a tomar ( es difícil determinar si es o no esperable para ese medicamento ya que no nos haces mención de aquellos que has utilizado). Si te duele el riñón aún con los medicamentos que los doctores consideran necesarios es pertinente que te examinen nuevamente y hagan la analítica correspondiente a ver si hay mas que esas bacterias que mencionas y el manejo antibiótico debe ser escalonado a algo mejor. La terapia dirigida a estos microorganismos debería estar siendo efectiva, pero como no lo es es pertinente cambiar el antibiótico y hacer los cultivos pertinentes para poder escoger el método en el que vas a ser tratado.