La faringe puede inflamarse cuando hay infeccion por virus o infeccion por bacterias. Entre los microbios causantes de faringitis se encuentran unos comunes como adenovirus o estreptococo pyogenes, y otros menos comunes como el causante de la difteria. En pacientes con un sistema de defensa bajo se puede dar una inflamacion de esta zona ocasionada por hongos.
Las alergias pueden causar rinitis (inflamacion de la mucosa de la nariz) o irritacion de los ojos o de la piel, pero no de la faringe.
Su duda es muy importante, espero haberla resuelto satisfactoriamente!