No, no es normal cuando hay una relación sexual no debe existir dolor o dispareunia. La alteración del ciclo podría estar relacionado con el cuadro de dolor. Sería bueno que se te realice un examen ginecológico para poder identificar la causa.
A mí parecer podrías estar presentando endometriosis. Una patología en donde la menstruación tiene un flujo retrógrado osea no todo el flujo menstrual sale sino que se va hacia la parte interna y alrededor de los órganos vecinos al útero.