Si el cuadro de faringoamigdalitis pultacea no mejora con la adecuada administración de penicilina benzatinica, amoxicilina, eritromicina o azitromicina por entre 3-10 días dependiendo de la pauta usada más tratamiento sintomático en necesario replantear el diagnóstico y tratamiento. Se deben tener en cuenta también diagnósticos diferenciales como amigdalitis pseudomembranosa, difteria y causas virales ya que el fracaso del tratamiento en faringoamigdalitis clásica es rara.