La causa de la mola hidtidiformoe es una sobreproducción de tejido que se convertirá en placenta por alteraciones cromosómicas, una mola completa es originada por un espermatozoide único fecunda un óvulo expulsado de su núcleo materno, con la consiguiente duplicación cromosómica, o por dos espermatozoides; lo que resulta en cada caso en un cariotipo diploide En el examen ecográfico, las molas completas revelan con escasa frecuencia un feto o líquido amniótico.
Una mola parcial se presenta cuando un espermatozoide único fecunda un óvulo que retiene su núcleo, generando los cariotipos triploides como 69 XXX, 69 XXY o 69 XYY, las molas parciales habitualmente muestran un feto y el líquido amniótico es visible.
Las molas hidatidiformes completas pueden convertirse en una mola invasora, la cual puede comportarse como un tumor maligno en poco casos.