Si la garganta se coloniza por ejemplo con VPH (Virus de papiloma humano) pueden aparacer lesiones de tipo condiloma o inclusive cancerígenas eventualmente (algunas cepas de VPH se relacionan con cáncer de esófago). Se pueden presentar también lesiones de garganta por infección con cándida (un hongo) o con gonorrea por ejemplo en el caso de las bacterias relacionadas con ETS o Enfermedades de Transmisión Sexual. La posibilidad de que sucedan existe siempre.