Sí tengo faringitis crónica, ¿es normal que algunos días esté mejor o parezca que estoy mejorando y al día siguiente esté de nuevo mal?

Sí, esto puede suceder. Lo más importante para que presente mejoría de manera permanente es que se determine la causa de la faringitis crónica y se dé tratamiento a esta.
Dentro de las causas se encuentran reflujo, sequedad ambiental, alergias, consumo crónico de tabaco o alcohol, entre otras.