La infección por Naegleria, ocasiona principalmente Meningoencefalitis Amebiana Primaria. Naegleria de la especie fowleri es un protozoo, una ameba de vida libre que está ampliamente distribuida por el mundo, se ha aislado en agua dulce, aguas termales y para hidroterapia, acuarios y cloacas. Afecta a niños y adultos jóvenes sanos. La puerta de entrada al sistema nervioso central es el nervio olfatorio a través del cual alcanzarían el parénquima cerebral, mediante invasión directa a través de la mucosa nasal, por inhalación de polvo o aspiración de agua o aerosoles contaminados. El período de incubación es de 5 a 7 días. El paciente sufre inicialmente cefalea intensa, fiebre alta, rigidez de nuca, náuseas y vómitos. El cuadro progresa con letargia, convulsiones, alteraciones del comportamiento, afección de los nervios, coma y muerte al cabo de unos 5 días, a consecuencia de hipertensión intracraneal. Su pronóstico es casi invariablemente fatal, aunque se debe intentar tratamiento con antibiótico con anfotericina B por vía intravenosa e intratecal junto a rifampicina. Es importante tener en cuenta que Naegleria fowleri es sensible al cloro, es por esto que el manejo adecuado de las las fuentes hídricas, es una medida preventiva.