Por lo general no debería suceder mayor cosa. La membrana del tímpano separa el conducto auditivo externo del oído medio. Cuando esta se perfora por alguna causa y en el oído medio cae líquido (siempre y cuando no sea un líquido contaminado) -en este caso es un medicamento-, el medicamento va estéril entonces no debería generar mayor problema.
Ahora bien, la persona quizás sí puede sentir algo de molestia al sentir el líquido ahí pero nada más o quizás puede sentir un sabor amargo al poco rato debido a que por la trompa de Eustaquio puede caer el medicamento y drenar en la orofaringe y la persona entonces siente el sabor.