Según lo que refieres puedes estar teniendo algo llamado papulosis perlada del pene. Es importante saber que esto NO es una infeccion de transmisión sexual. Simplemente es una condición dermatológica que puede aparecer en cualquier hombre
Si son incomodas o deseas realmente retirarlas te aconsejo una consulta al especialista (urologo) para que pueda referirte al retiro quirurgico o con laser de estas lesiones