Mi novio tiene sistitis avanzada, lleva con eso 3 semanas y hemos tenido relaciones sin protección, es malo?

No, no es malo.

La cistitis no es una enfermedad de transmisión sexual, por lo que no te va a infectar por esto, sin embargo, debe iniciar rápidamente un tratamiento para evitar posibles complicaciones.

Espero haberte ayudado y estaré atento si tienes más dudas para poder orientarte.