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Si, éste podría tratarse de un efecto secundario usual del medicamento anticonceptivo.
Depo prodasone es un método anticonceptivo inyectable que contiene medroxiprogesterona y dentro de los efectos adversos de estos medicamentos se encuentran: dolor pélvico, dolor en el busto, irritabilidad, dolor de cabeza, náuseas y vomito, aumento del flujo vaginal e irregularidades del periodo, así que si es muy posible que tus síntomas sean por el medicamento.
Si los síntomas se vuelven intensos o persisten, debes consultar con tu médico para que te revise y estudie si pueden haber otras causas o si requieres algún tratamiento específico.
Espero haber podido ayudarte y orientarte.