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El pene no se hace pequeño. Acaso podría ocurrir en la adultez tardía, entrando en la vejez, a causa de disminución de la producción de testosterona en los testículos.
En una persona de 13 años no tendría sentido que se hiciera pequeño. Podría ocurrir que no se desarrollara, lo cual es distinto, y eso podría deberse de la misma forma a una deficiencia en la producción de testosterona en los testículos.
En tal caso, convendría consultar con un endocrinólogo para verificar que el estado de desarrollo sexual sea el adecuado para la edad, y en caso necesario, solicitar algunos exámenes para descartar que tenga algo llamado hipogonadismo.
Espero haber resuelto sus dudas y quedo al pendiente de cualquier otra situación. Si la orientación le ha resultado de utilidad por favor califíquela positivo.