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Las pastillas deben iniciarse en los primeros 5 días del ciclo menstrual para que estas te protejan desde el primer día de la toma, en tu caso al iniciarlas en el segundo día estas protegida desde el primer día.
Recuerda que las pastillas anticonceptivas son efectivas en un 98 a 99% si se toman adecuadamente, el objetivo de los anticonceptivos hormonales es evitar un embarazo porque inhibe la ovulación y al no haber ovulación el espermatozoide no tiene que fecundar, otros de los efectos es reducir el grosor endometrial para que exista dificultad en la implantación y aumenta el moco cervical para imposibilitar el paso de los espermatozoides, por lo tanto pueden tener relaciones sexuales con eyaculación en el canal vaginal sin el uso de preservativo y estarán protegidos de embarazo, solo recuerda que el condón previene enfermedades de transmisión sexual.
Si tienes más dudas es necesario que vuelvas a formular otra pregunta, estaré al pendiente de tus dudas.