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El ejercicio si puede influir a la disminución del sangrado y dolor menstrual, si es en exceso puede causar alteraciones menstruales, si no es en exceso no tienes de que preocuparte, si es en exceso se recomienda disminuir la intensidad.
Toma en cuenta que se descarta un embarazo con la prueba que realizaste, y debes saber que tener sangrados de 3 días no es malo, de hecho se considera normal un sangrado menstrual de 2 a 7 días.
Si no deseas un embarazo y deseas tener relaciones sexuales, se recomienda el uso de métodos anticonceptivos, toma en cuenta que no se recomienda el uso de métodos naturales porque tienen alto porcentaje de falla, el condón es el único método que es capaz de protegerte de infecciones de transmisión sexual.
Si tienes más dudas es necesario que vuelvas a formular otra pregunta, estaré al pendiente de tus dudas.