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Es necesario pensar como primera opción en una infeccion vulvovaginal, estas infecciones se acompañan de flujo que usualmente tiene mal olor, produce rasquiña o dolor en la región pélvica.
También es importante que teniendo en cuenta tu edad y la presencia de ese color marrón, sea necesario descartar la posibilidad de un embarazo, es poco probable pero si sigues teniendo flujo marrón eventualmente será necesario descartarlo.
Espero haberte ayudado y estaré atento si tienes más dudas para poder orientarte.