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No el enjuague bucal aunque tenga medicamento no afecta la eficacia de los anticonceptivos, no debes preocuparte pues estas protegida de un embarazo en hasta un 98 a 99%, es importante que continues con la ingesta de los anticonceptivos si no deseas un embarazo.
Es recomendable que acudas con tu odontólogo para que pueda darte un tratamiento adecuado para la situación por la que estas pasando.
Si tienes más dudas es necesario que vuelvas a formular otra pregunta, estaré al pendiente de tus dudas.