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Mebendazol es un medicamento antiparasitario que actúa bloqueando la formación del parásito en la vía digestiva, por lo que le causa la muerte y la infección queda erradicada.
Para responder a tu pregunta, el medicamento puede ser chupado o tragado entero, así que si lo ingeriste por completo (sin chupar) con agua, igual debería tener efecto.
Espero haber podido ayudarte y orientarte.