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El color del semen es normalmente blanco pálido o blanco lechoso o levemente amarillento, por las flavinas provenientes de la vesícula seminal. Si el líquido eyaculado presenta un color anaranjado o rojizo, es posible que contenga sangre, signo que se conoce como hematospermia, que puede indicar un trastorno urológico.
El semen rojizo -o de algún otro color raro, como amarillo o verde- aparece con bastante frecuencia, y no suele ser síntoma de problemas de gravedad, sin embargo si es un de una tonalidad verdosa intensa a menudo con mal olor, y un antecedente de conductas de riesgo , también señala la presencia de bacterias u hongos responsables de alguna infección o una enfermedad de transmisión sexual.
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