Con el uso de los anticonceptivos subdérmicos se pueden presentar algunos efectos secundarios como sangrado intermenstrual, Cefalea, aumento de peso, Melasma, y ausencia de la menstruación. Lo que genera el uso de estos métodos es que no se produzca la ovulación y al pasar esto no se forma el endometrio y no hay sangrado menstrual, es un efecto esperado por el uso del método de planificación y no pone en riesgo la salud.