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Lo más probable es que las alteraciones en tu ciclo menstrual se debe a la pastilla del día después. Recuerda que dentro de los efectos secundarios más comunes se encuentran as alteraciones menstruales pudiendo presentar un sangrado después de la toma, irregularidad menstrual o un retraso menstrual no mayor a 3 semanas. Además, realizaste una prueba de embarazo que es confiable y es negativa por lo que no podrás estar en embarazo.
Los síntomas que refieres, aunque podrían estar en relación con un embarazo, en tu caso al presentar tus menstruaciones después de tu última relación sexual, no es posible que te encuentres en embarazo.
Si no deseas un embarazo, te recomiendo además del uso del preservativo, iniciar un método anticonceptivo hormonal. Puede solicitar una cita de planificación familiar, donde realizarán una valoración clínica completa e indicarán el mejor método anticonceptivo que se ajuste a tus necesidades.
Espero haber podido ayudarte. Si tienes alguna otra pregunta, no dudes en hacerla en nuestra plataforma.