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No, no la afecta.
La inyección del medicamento anticonceptivo ocurre a nivel muscular, esto quiere decir que inmediatamente después de su aplicación inicia todo su proceso de absorción y distribución a todo el organismo. Por lo que ninguna actividad o procedimiento en el área de la inyección va a afectar le efectividad del medicamento.
Debes estar tranquila, puedes seguir con tu vida normal.
Espero haberte ayudado y estaré atento si tienes más dudas para poder orientarte.