Hay complicaciones que se relacionan con todas las cirugías como sangrado, infección, requerimiento de intervención y otras con el procedimientos especifico a realizar. Si el procedimiento a realizar es simpatectomía torácica endoscópica puede presentar sudoración de compensación o reflejo que puede aparecer en pecho y espalda (no en todos los casos), dolor cara anterior del tórax el cual remite espontáneamente a las pocas semanas, neomotorax. Sin embargo, el hecho que estén descritos no quiere decir que los vaya a presentar.
La persona más idónea para hablarle sobre los riesgo es el cirujano que vaya a realizar el procedimiento, el cual debe solucionar todas sus dudas y preguntar acerca el tratamiento que va a recibir.