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No hay problema, muchas veces tomar anticonceptivos con menor dosis (como ISIS 20) puede no adaptarse a tu organismo y causar esta alteración menstrual, esto no afectará la efectividad del anticonceptivo.
Para que realices el cambio adecuadamente deberás tomar ISIS cuándo termine el descanso de ISIS 20, y de esa manera seguirás con el efecto protector de la pastilla, si esperas a empezar la nueva caja deberás utilizar preservativo por 7 días.
Estaré al pendiente de tus dudas.