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En caso de que llegues a presentar dolor pélvico, fiebre, sangrado o flujo vaginal fétido, dolor con las relaciones sexuales, debes consultar de forma prioritaria ya que éstos pueden ser signos de alarma.
Para responder a tu pregunta, uno de los efectos adversos más frecuentes de los anticonceptivos de uso habitual (cómo los anticonceptivos orales) es la irregularidad del ciclo menstrual, pudiendo producir sangrados persistentes, retrasos y ausencias del periodo, variación de la cantidad de sangrado menstrual, entre otros.
Es probable que tu manchado sea un efecto secundario del medicamento, si se vuelve persistente o abundante, debes consultar para que tu médico determine si requieres algún tratamiento específico, espero haber podido ayudarte y orientarte.