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La amoxicilina NO va a alterar tus días fértiles.
La ampxi ilina es un antibiótico betalactamico que por su mecanismo de acción NO interfiere con el ciclo menstrual y NO va a causar ningúna pérdida de los días fértiles, por lo que no deberías preocuparte.
Tampoco lo harán otros antibióticos como la penicilina benzatinica.
Espero haberte ayudado y estaré atento si tienes más dudas para poder orientarte.