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El escozor es probablemente por la humedad y uso del condón, además e interrupción del tratamiento tópico más que inefectividad del mismo, además no creo que tenga relación a las comidas consumidas.
Sugiero continuar tratamiento como indicado y asistir a control con médico tratante para asegurarse de estado de infección y erradicación. Lo más prudente es no tener relaciones sexuales hasta culminado todo el preceso por el que está cursando.
Si podemos ayudar en algo más, estamos para servirle.