La única forma de saber quién es el padre, es con la realización de una prueba de ADN, si tuviste relaciones sexuales con los dos hombres, sin utilizar protección (preservativo), ambos tiene probabilidad de ser el padre del bebé.
Si crees que la realización de la prueba de ADN te va a traer problemas te recomiendo asistir con un profesional ya sea médico o psicólogo para que te orienten en el proceso y en cómo abordar el tema con las personas implicadas.
Es importante tener presente que el uso de métodos de planificación de barrera como el preservativo ayuda no solo a evitar embarazos sino también a evitar que adquiramos enfermedades de transmisión sexual.
Espero haber resuelto tu duda, si tienes otras inquietudes con gusto se te resolverán.